À l’écart des fastes des autres îles Borromées, l’îlot de San Giovanni ne manque pas de fasciner les touristes qui peuvent l’admirer de près en se promenant sur les rives du lac à Pallanza.
L’histoire de cette petite île est liée à la vie de nombreuses personnalités illustres, comme le grand chef d’orchestre Arturo Toscanini, qui y résida de 1927 à 1952, entouré d’un étroit cercle d’amis.
Cité pour la première fois comme "Isola di Sant'Angelo" dans un document rédigé en 999 ap. JC, l’ilot abritait un château et une église dédiée à Saint Michel Archange. Quand cette église fut détruite, l’ilot prit alors le nom de "S. Giovanni", en référence à l’oratoire où se trouve un font baptismal consacré à Saint Jean.
La famille Borromée en devint propriétaire au 17ème siècle et fit embellir les jardins et les habitations. Le palais, en partie similaire à celui de l’Isola Madre, fut réaménagé au cours des siècles pour avoir depuis la première moitié du 19ème siècle l’aspect actuel. Le parc est en majorité occupé par des arbres.
L'Isolino di San Giovanni et son palais ne peuvent pas être visités mais on peut en admirer la beauté en se promenant sur la promenade de Pallanza.